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兒科研究所成立于1979年，是醫(yī)院的科研實驗平臺和研究生培養(yǎng)的基地，主要承擔支撐學科、轉(zhuǎn)化研究和服務臨床的重要任務，為科研項目的開展提供實驗技術(shù)支撐和服務，為研究生實驗研究能力的培養(yǎng)提供指導和幫助。
兒研所管理框架下?lián)碛行l(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室、上海市兒童出生缺陷防治重點實驗室、復旦大學兒童發(fā)育與疾病轉(zhuǎn)化醫(yī)學中心和復旦大學生殖發(fā)育研究院（兒科分部），并設有分子醫(yī)學中心、公共實驗平臺、病原學實驗室、臨床信息生物樣本庫、斑馬魚平臺、小鼠動物平臺、干細胞平臺以及臨床流行病學研究室、臨床指南制作與評價中心、兒童健康與政策研究中心。目前，兒研所已經(jīng)擁有一支梯隊層次合理，團結(jié)奮進，朝氣蓬勃，極富創(chuàng)新能力的科研團隊。
衛(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室
衛(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室成立于2005年10月，2009年2月通過衛(wèi)生部組織的專家驗收。2010年底首批入選為國家臨床重點專科—衛(wèi)生部重點實驗室建設項目。實驗室主任桂永浩教授，副主任楊毅教授和陳超教授，第三屆學術(shù)委員會主任為杜立中教授。
實驗室以進一步提高我國危重新生兒的救治水平，降低病死率和傷殘率為主要目標，針對在我國導致新生兒死亡和傷殘的突出問題：早產(chǎn)、呼吸衰竭、腦損傷、重要臟器畸形、感染等開展新理論和新技術(shù)的研發(fā)和推廣應用。在新生兒腦損傷的發(fā)生機制與防治及早期康復干預、肺發(fā)育與損傷、早產(chǎn)兒生命支持和先心及重要臟器畸形的分子機制與早期診治等領(lǐng)域研究處于國內(nèi)領(lǐng)先的地位，達到國際先進的水平。
實驗室近5年承擔國家級、省部級及國際合作研究項目80余項，研究經(jīng)費近4千萬。研究成果獲得教育部科技進步二等獎3項，上海市科技進步二等獎1項，中華醫(yī)學二等獎2項、三等獎1項，上海醫(yī)學科技二等獎2項?，F(xiàn)有正高職稱人員18人，副高職稱人員5人，中初級人員17人。
上海市出生缺陷防治重點實驗室
上海市出生缺陷防治重點實驗室于2013年09月由上海市科委批準籌建，是國內(nèi)唯一落戶于兒童專科醫(yī)院專業(yè)開展出生缺陷防治的基礎(chǔ)和臨床研究的重點實驗室。實驗室主任黃國英教授，賀林院士為第一屆學術(shù)委員會主任。實驗室設立了三個主攻方向：（1）先天性心臟病發(fā)生學、早期預警與干預；（2）神經(jīng)發(fā)育障礙遺傳學機制與規(guī)范化診治技術(shù)；（3）重大內(nèi)臟畸形病理機制與修復重建。
實驗室以先天性心臟病、神經(jīng)發(fā)育障礙（孤獨癥、先天性智障、遺傳性代謝病等）、重要器官臟器畸形（消化和泌尿系統(tǒng)畸形）等嚴重致死致殘性疾病為重點，圍繞遺傳和環(huán)境交互作用的科學問題展開研究，闡明上述重大出生缺陷的病因和發(fā)生機制，研發(fā)早期診治新技術(shù)和新策略。
實驗室在重大出生缺陷的病因研究、分子基因診斷、臨床干預治療等方面取得了突破性進展。新生兒先心病篩查方案研究成果發(fā)表于《lancet》，是該雜志自1823年創(chuàng)刊以來首次刊登我國兒科學界的研究論著，標志著我國新生兒先天性心臟病篩查工作躋身國際領(lǐng)先水平。研究成果被上海市衛(wèi)計委列入2015年推廣開展的惠民項目，2016年在上海市所有助產(chǎn)機構(gòu)都進行了推廣實施；2017年受國家衛(wèi)生計生委委托，負責啟動全國范圍內(nèi)的新生兒先心病篩查方案制定，在全國推廣應用。
復旦大學生殖與發(fā)育研究院兒科分部
復旦大學生殖與發(fā)育研究院于2014年3月正式揭牌成立，由復旦大學附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院、復旦大學附屬兒科醫(yī)院與上海市計劃生育科學研究所三家單位共同籌建，是聯(lián)合復旦大學校內(nèi)生殖與發(fā)育相關(guān)學科的科研資源共同組建而成的跨部門、跨學科的研究機構(gòu)。兒科分部主要涉及神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、神經(jīng)腫瘤、Hippo信號轉(zhuǎn)導通路與腫瘤發(fā)生、染色質(zhì)重塑與神經(jīng)發(fā)育、腸道微生物等研究方向。
復旦大學兒童發(fā)育與疾病轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中心
復旦大學兒童發(fā)育與疾病轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中心正式成立于2009年12月，轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中心以轉(zhuǎn)化醫(yī)學理念為指導，以發(fā)育生物學和出生缺陷研究為主攻方向，并致力于搭建兒科學與其他學科間的橋梁，建立穩(wěn)定學科交叉合作機制，注重從臨床問題到實驗室研究，再從實驗室新技術(shù)研發(fā)到應用于臨床診斷，建設好復旦大學兒童發(fā)育與疾病轉(zhuǎn)化醫(yī)學科技創(chuàng)新平臺，提升醫(yī)院整體醫(yī)療水平，降低5歲以下兒童的病死率和致殘率。
分子醫(yī)學中心
復旦大學附屬兒科醫(yī)院分子醫(yī)學中心成立于2011年，由分子診斷實驗室、質(zhì)譜室、細胞遺傳實驗室和新生兒篩查中心組成，為臨床提供遺傳相關(guān)疾病的檢測服務。作為上海市衛(wèi)生局定點的三家新生兒篩查中心之一，新生兒篩查中心承擔來自十余家助產(chǎn)機構(gòu)每年出生的約4萬新生兒四項疾病的篩查。自2015年獲批國家高通量測序試點實驗室以來，大力開展基于二代測序的高通量檢測項目，包括各?？萍膊∠嚓P(guān)的panel，臨床外顯子以及全外顯子組檢測，建立了24個小時家系WES快速診斷流程，在臨床疑難危重癥遺傳病的快速診斷中發(fā)揮了重要作用?，F(xiàn)有臨床醫(yī)師4人，實驗室技術(shù)員17人，并擁有一支由臨床多個?？瀑Y深教授組成的專家團隊對基因檢測報告進行審核和解讀。
公共實驗平臺
主要為全院科研項目的開展和研究生課題研究提供實驗場地和技術(shù)支撐與服務，面向所有研究生及科研人員開放使用?？商峁┑膶嶒灱夹g(shù)包括常規(guī)分子生物學技術(shù)、細胞生物學技術(shù)、流式細胞檢測技術(shù)和病理形態(tài)分析技術(shù)等。下設分子生物學實驗室、細胞實驗室、免疫組化形態(tài)學實驗室、動物取材室和動物造模室。中心實驗室采取開放式大實驗室設計，包括64個實驗臺、37個研究生座位。實驗室配有1間冷庫及2間冰箱房用于生物樣本和試劑的儲存。實驗室主要的大型設備包括熒光定量PCR儀、流式細胞儀、熒光化學發(fā)光儀、Leica組織形態(tài)學處理設備、熒光顯微分析設備，包括具備自動掃描載物臺，可進行大圖片拼接的Leica 6000B，以及可進行四色熒光顯微成像、免疫熒光定位、定量、三位重組和動態(tài)測量的Leica SP8設備等。
臨床信息與生物樣本庫
以復旦大學附屬兒科醫(yī)院豐富的臨床病例資源為基礎(chǔ)，建立了規(guī)范化的病例收集、樣本處理、儲存及質(zhì)量控制系統(tǒng)，實現(xiàn)了生物樣本的規(guī)范化收集、管理和使用。醫(yī)院采用基于整體戰(zhàn)略儲備的一級庫，以及基于科室和課題組需求的二級樣本庫，配備了一批深低溫冰箱和溫度監(jiān)控系統(tǒng)，以及在線的軟件錄入系統(tǒng)，為樣本收集提供便利條件和管理服務。樣本庫”已獲人類遺傳資源行政許可（國科遺辦審字【2017】508號HGR-2017-7-96)。
斑馬魚研究平臺
已建成可容納12000條成魚的飼育系統(tǒng)，可同時滿足多個研究小組進行斑馬魚相關(guān)研究。平臺配備了顯微注射系統(tǒng)、動物行為記錄和分析系統(tǒng)、高分辨率熒光顯微鏡等設備，也成功建立了先進的CRISPR-Cas9基因敲除、焦慮、社交等相關(guān)行為分析技術(shù)。這些建設推動了在分子、細胞和整體水平開展的發(fā)育疾病相關(guān)功能研究。
目前兒研所斑馬魚實驗平臺主要開展的項目包括：（1）斑馬魚基因敲除模型構(gòu)建：基于CRISPR-Cas9技術(shù)；（2）斑馬魚轉(zhuǎn)基因品系構(gòu)建：基于轉(zhuǎn)座酶技術(shù)；（3）基因或藥物對斑馬魚運動行為特征的影響分析：神經(jīng)精神系統(tǒng)疾病相關(guān)，運動系統(tǒng)相關(guān)，內(nèi)分泌等相關(guān)；（4）基因突變或小分子化合物對斑馬魚形態(tài)、器官、發(fā)育等的影響及分析。
小鼠動物平臺
已建立擁有國際水準的SPF級及IVC小鼠飼養(yǎng)室，可提供SPF級小鼠飼養(yǎng)和動物行為學檢測等服務。擁有顯微操作設備技術(shù)和專業(yè)動物飼養(yǎng)管理團隊。平臺配有萬級凈化室，并設有2間更衣室、風淋室、飼養(yǎng)室以及緩沖間，實行單向進出路線，并設有物品傳遞窗。動物房使用IVC小鼠獨立通氣飼養(yǎng)系統(tǒng)，科研樓5樓動物房可容納7個籠架1512個小鼠飼養(yǎng)籠盒，7樓可容納10個籠架2142個小鼠籠盒，并且各配有超凈臺進行各項實驗操作。
干細胞平臺
已建立包括基因編輯實驗室及萬級凈化干細胞培養(yǎng)房，配備了6臺生物安全柜?？蛇M行病人來源的皮膚細胞及外周血細胞重編程誘導多能干細胞系的構(gòu)建。另有專門的細胞分化房，可進行多能干細胞的體外誘導分化至神經(jīng)系統(tǒng)細胞，內(nèi)胚層細胞等?；蚓庉嬈脚_：配有常規(guī)PCR、細菌培養(yǎng)、電轉(zhuǎn)儀等儀器設備，可開展人干細胞基因編輯工作。
臨床流行病學研究室
臨床流行病學研究室成立于2011年1月，主要研究方向“兒童肥胖相關(guān)疾病遺傳學研究和人群防治”，同時作為服務于臨床研究的共享技術(shù)平臺，為我院大型臨床研究申請立項、優(yōu)化研究設計、實施質(zhì)控、數(shù)據(jù)管理、統(tǒng)計分析和發(fā)表論文提供流行病學和生物統(tǒng)計學專業(yè)技術(shù)支持。同時承擔臨床流行病學教學、科研咨詢和專題講座，不斷提高我院醫(yī)生、研究生的臨床研究素養(yǎng)和能力。
科室擅長的專業(yè)方向和領(lǐng)域：（1）隨機化臨床試驗（RCT）的全套解決方案：研究設計、注冊、樣本量設計、隨機化分組方案、數(shù)據(jù)管理、統(tǒng)計分析、論文撰寫支持。（2）基于真實世界病人臨床數(shù)據(jù)的療效比較分析、預后因素分析、診斷準確性分析。
臨床指南制作和評價中心
成立于2017年4月，旨在加快落實國家兒童醫(yī)學中心建設，提高兒科疾病、公共衛(wèi)生領(lǐng)域的臨床指南或?qū)＜夜沧R等的制定。主要工作方向包括：（1）宣傳、倡導和踐行規(guī)范化制定臨床指南；（2）審議、指導和監(jiān)督中國兒科臨床指南制定工作委員會成員醫(yī)院提議制作的指南；（3）利用兒科臨床指南制定工作委員會專家的學術(shù)影響力推廣臨床指南的解讀和應用；（4）組織培訓指南制作流程和重要環(huán)節(jié)（文獻檢索策略、文獻評價工具、Meta分析和GRADE等）
兒童健康與政策研究中心
成立于2017年12月，以加快落實國家兒童醫(yī)學中心建設，建立兒童健康政策研究平臺為宗旨，主要開展兒童健康發(fā)展戰(zhàn)略和管理政策、兒科醫(yī)療運行機制、兒科學科人才發(fā)展策略、互聯(lián)網(wǎng)+兒童健康信息管理模式等兒童健康重大問題研究，為推進國家兒童醫(yī)學中心建設和醫(yī)院管理創(chuàng)新提供政策咨詢和決策支持。
2018.3更新
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