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復旦大學附屬兒科醫(yī)院本著公平、公開、公正的原則，對復旦大學附屬兒科醫(yī)院Alamut Visual軟件升級及許可證采購項目進行公告。
一、項目主要建設(shè)內(nèi)容：
分子醫(yī)學中心擬在2020年已采購Alamut Visual軟件（由Sophia Genetics公司提供）的基礎(chǔ)上，對軟件進行升級（升級后為Alamut Visua Plus）并續(xù)約一年的軟件使用授權(quán)許可證，以用于協(xié)助基因診斷過程中的變異分析。
該軟件在基因組學研究領(lǐng)域被廣泛認可，能夠提供實時、精確、廣泛的遺傳變異注釋信息，輔助遺傳咨詢?nèi)藛T對遺傳變異的功能進行更準確的解讀，提升分析和篩選遺傳變異的效率。
軟件采取授權(quán)碼在線認證方式進行使用授權(quán)，不限安裝次數(shù)。授權(quán)費用根據(jù)可允許同時使用的最大用戶數(shù)而不同。經(jīng)過權(quán)衡，分子醫(yī)學中心擬續(xù)約最多允許三名用戶同時使用的授權(quán)碼，授權(quán)有效期一年，為自2020年采購后的續(xù)約。該授權(quán)包括了有效期內(nèi)的數(shù)據(jù)庫訪問和更新、軟件升級和維保，以及Alamut Visual軟件的功能升級，相比原版主要增加功能包括：
1. 增加了Extranet界面，Extranet為Alamut Visual Plus的管理器，可以添加管理Alamut Visual Plus用戶，查看License激活情況、License細節(jié)如到期時間等。
2. 界面更新，相對原版采用了更為人性化及美觀的界面。將所有人類突變相關(guān)的頻率數(shù)據(jù)庫整合到一個Track中（包含新增的1000 Genomes和Danish2K，以及原有的dbSNP，gnomAD，ESP，GoNL，HGVD）。
3. 新增Genomic Views頁面，可視化所有染色體包括線粒體染色體。
4. 新增結(jié)構(gòu)變異的注釋Track注釋，通過DGV數(shù)據(jù)庫展示了基因組中的結(jié)構(gòu)變異。DGV（Database of Genomics Variant）提供了一個人類基因組結(jié)構(gòu)變異（Structural Variation）的綜合總結(jié)，其中定義結(jié)構(gòu)變異為涉及DNA片段超過50bp的基因組改改變，數(shù)據(jù)庫內(nèi)容只展示在健康樣本中識別的結(jié)構(gòu)變異。
5. 新增Repeat Masker的注釋Track，展示重復DNA區(qū)域。通過DGV數(shù)據(jù)庫展示了基因組中的結(jié)構(gòu)變異。DGV（Database of Genomics Variant）提供了一個人類基因組結(jié)構(gòu)變異（Structural Variation）的綜合總結(jié)，其中定義結(jié)構(gòu)變異為涉及DNA片段超過50bp的基因組改改變，數(shù)據(jù)庫內(nèi)容只展示在健康樣本中識別的結(jié)構(gòu)變異。
6. 新增ACMG-AMP變異解讀指南。美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會（American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG）在一篇2015的報告中，提供了在臨床語義中，針對遺傳疾病的序列變異的報告和解讀。用戶可以基于科學語境調(diào)整變異證據(jù)。選擇的證據(jù)接著會展示在變異面板中。建議的ACMG致病分類由用戶選擇的證據(jù)評估。
7. 優(yōu)化變異注釋頁面，將不同Track的注釋都整合到這個頁面中來，預測功能和自建變異信息也整合在此界面中。
8. 優(yōu)化報告導出功能，美化了固定模板，導出變異報告時可自定義導出字段。
9. 新增Sanger電泳圖譜功能，支持上傳Sanger電泳圖譜（Sanger Electropherogram）數(shù)據(jù)。
10. 新增API功能，外部工具可以通過API控制軟件。
二、本次采購要求：
1、 項目工期：合同簽署后的7天內(nèi)完成。
2、 項目最高采購限價：4.5萬元人民幣，高于最高采購限價將予以否決。
3、 售后服務(wù)要求
維保期限：免費提供1年軟件的質(zhì)保服務(wù)，質(zhì)保期自驗收合格，雙方簽字的次日起算。
故障響應(yīng)：應(yīng)提供7*24小時應(yīng)急服務(wù)，在接到報修通知后，應(yīng)在10分鐘內(nèi)響應(yīng)，2小時內(nèi)趕到現(xiàn)場，查找原因，提出解決方案，修復時間應(yīng)不超過1個工作日。
三、對響應(yīng)人資格要求：
1. 響應(yīng)人必須是在中華人民共和國境內(nèi)注冊、具有獨立法人資格的單位，須提供加蓋公章的工商營業(yè)執(zhí)照復印件；
2. 本次采購不接受聯(lián)合體響應(yīng)。
四、響應(yīng)文件：
1、 響應(yīng)文件內(nèi)容：
（1）公司營業(yè)執(zhí)照，相關(guān)資質(zhì)證明文件，加蓋單位公章；
（2）本項目報價方案、軟件功能列表、維保承諾、故障響應(yīng)承諾，加蓋單位公章；
（3）公司相關(guān)案例等，加蓋單位公章；
（4）關(guān)于近三年無行賄犯罪情況的書面聲明（見附件，自行下載），加蓋單位公章。如不是法人簽名，代理人簽名需附授權(quán)文件。
2、響應(yīng)文件遞交：
（1）遞交截止時間：2021年8月2日17點整
（2）遞交地點：閔行區(qū)萬源路399號復旦大學附屬兒科醫(yī)院信息網(wǎng)絡(luò)管理中心
（3）遞交方式：以打印文件形式提供，并密封加蓋騎縫章包裝
六．聯(lián)系方式：
聯(lián)系人：鄒老師
聯(lián)系電話：021-64931983
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